تتولى إدراة التصميم الاختصاصات التالية:
- إعداد التصاميم الهندسية المختلفة لتجديد وإنشاء شبكات وخطوط الصرف الصحي ومحطات الضخ والرفع ومحطات التنقية وشبكات وخطوط المياه المعالجة والري ومراكز التحكم وما يلزم من دراسات.
- إعداد وتجهيز جميع المستندات ووثائق العقود المتعلقة بمشاريع الهندسة الصحية واستكمال إجراءات طرحها بالتنسيق مع الجهات المعنية.
وتتكون إدارة التصميم من الأقسام الآتية :
- قسم الدراسات والتصميم .
- قسم العقود.
- قسم الخدمات المساندة.